MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli UMNK88 plasmid pUMNK88_K88

Total Repeats: 399

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017639	CCT	2	6	764	769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_017639	AAT	2	6	773	778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017639	A	6	6	826	831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017639	GCA	2	6	832	837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017639	A	6	6	846	851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017639	TCA	2	6	857	862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017639	CGG	2	6	1541	1546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017639	GCC	2	6	1579	1584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_017639	ACA	2	6	1607	1612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017639	G	6	6	2291	2296	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017639	GCT	2	6	2364	2369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017639	CTG	2	6	2398	2403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017639	TGA	2	6	2888	2893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017639	GAA	2	6	2923	2928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017639	TTTTC	2	10	3011	3020	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017639	CCTGG	2	10	3045	3054	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_017639	CGG	2	6	3690	3695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017639	CAC	2	6	3712	3717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_017639	AGG	2	6	3735	3740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017639	CAT	2	6	3785	3790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017639	GCA	2	6	3810	3815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017639	TTGTTT	2	12	3839	3850	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017639	T	7	7	3887	3893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017639	GTT	2	6	3903	3908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017639	TGTGC	2	10	3909	3918	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017639	TGT	3	9	3924	3932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017639	T	6	6	3935	3940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017639	CGT	2	6	4029	4034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017639	TGT	2	6	4035	4040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017639	TGC	2	6	4081	4086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017639	T	7	7	4135	4141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017639	GAA	2	6	4185	4190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017639	GCT	2	6	4199	4204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017639	GA	3	6	4250	4255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017639	GTC	2	6	4307	4312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017639	TTA	2	6	4379	4384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017639	T	7	7	4403	4409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017639	TAA	2	6	8214	8219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017639	T	8	8	8783	8790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017639	TAT	2	6	8916	8921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017639	TGA	2	6	9804	9809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017639	TAT	2	6	9820	9825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017639	AGG	2	6	11561	11566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017639	TGG	2	6	12381	12386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017639	TGGT	2	8	12388	12395	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017639	TG	3	6	12399	12404	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017639	TGG	2	6	12465	12470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017639	ATT	2	6	12765	12770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017639	CTC	2	6	13334	13339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_017639	GAA	2	6	14798	14803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017639	TTC	2	6	14842	14847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017639	TATGGG	2	12	16040	16051	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017639	TGA	2	6	16059	16064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017639	CGC	2	6	16077	16082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_017639	CAGC	2	8	16085	16092	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017639	GCA	2	6	16115	16120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017639	TTC	2	6	16610	16615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017639	ATC	2	6	16641	16646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017639	TTG	2	6	16755	16760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017639	CAGA	2	8	16794	16801	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017639	AATA	2	8	19350	19357	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017639	TTG	2	6	19376	19381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017639	A	7	7	19421	19427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017639	TTC	2	6	19503	19508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017639	CT	3	6	19529	19534	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017639	AT	3	6	19605	19610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017639	AATAA	2	10	19654	19663	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017639	AATG	2	8	19704	19711	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017639	T	8	8	19721	19728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017639	ATA	2	6	19730	19735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017639	CCT	2	6	19781	19786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_017639	GC	3	6	19800	19805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017639	A	6	6	21317	21322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017639	TA	3	6	21323	21328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017639	AGG	2	6	21330	21335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017639	CGTT	2	8	23081	23088	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017639	AAAC	2	8	24212	24219	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017639	TAA	2	6	24302	24307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017639	TTA	2	6	24370	24375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017639	AAAG	2	8	24387	24394	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017639	TCAG	2	8	24403	24410	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017639	ATT	2	6	24435	24440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017639	CAT	2	6	24459	24464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017639	A	6	6	24488	24493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017639	ATT	2	6	25419	25424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017639	ATG	2	6	25450	25455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017639	TCT	2	6	25472	25477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017639	TTA	2	6	25499	25504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017639	TTC	2	6	25527	25532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017639	GGA	2	6	25540	25545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017639	TG	3	6	25546	25551	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017639	AAAG	2	8	25594	25601	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017639	TCA	2	6	25708	25713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017639	CGG	2	6	25748	25753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017639	AAGG	2	8	25786	25793	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017639	T	6	6	25812	25817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017639	CAC	2	6	25818	25823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_017639	TTC	2	6	25842	25847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017639	GCC	2	6	25887	25892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_017639	GT	4	8	25906	25913	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017639	AAG	2	6	26976	26981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017639	AT	3	6	26989	26994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017639	ATT	2	6	27004	27009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017639	CTA	2	6	27021	27026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017639	CAT	2	6	27149	27154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017639	CTG	2	6	27199	27204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017639	GTGA	2	8	27259	27266	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017639	GGCA	2	8	27388	27395	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017639	AGG	2	6	27429	27434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017639	GAA	2	6	27534	27539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017639	ATG	2	6	28499	28504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017639	CCT	2	6	28549	28554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_017639	GTG	2	6	28572	28577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017639	CCG	2	6	28594	28599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_017639	ACCG	2	8	28753	28760	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017639	GTG	3	9	30053	30061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017639	AAC	2	6	30092	30097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017639	TA	3	6	31269	31274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017639	TTA	2	6	31988	31993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017639	GT	3	6	32015	32020	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017639	T	7	7	32020	32026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017639	GAA	2	6	32064	32069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017639	ACC	2	6	32075	32080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_017639	GGC	2	6	32096	32101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017639	CTG	2	6	32129	32134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017639	TTG	2	6	32196	32201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017639	TGT	2	6	32717	32722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017639	CCA	2	6	32724	32729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_017639	AGT	2	6	32763	32768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017639	T	6	6	34760	34765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017639	CGG	2	6	34818	34823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017639	AT	3	6	34832	34837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017639	CTG	2	6	34843	34848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017639	ATT	2	6	34892	34897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017639	TGT	2	6	36903	36908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017639	ACA	2	6	36924	36929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017639	TGA	2	6	38129	38134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017639	ATC	2	6	38521	38526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017639	GCT	2	6	38550	38555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017639	ACTG	2	8	38576	38583	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017639	GCTCT	2	10	38720	38729	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
142	NC_017639	TAAA	2	8	41539	41546	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017639	CA	3	6	41579	41584	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_017639	GTAT	2	8	41614	41621	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017639	CA	3	6	41644	41649	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_017639	TAAT	2	8	41656	41663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017639	TAT	2	6	41688	41693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017639	CAA	2	6	41728	41733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_017639	TAA	2	6	41743	41748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017639	T	6	6	41755	41760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017639	CGA	2	6	41810	41815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_017639	TGT	2	6	41842	41847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017639	GCT	2	6	41882	41887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_017639	C	6	6	41914	41919	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
155	NC_017639	TGC	2	6	41929	41934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_017639	C	7	7	41938	41944	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
157	NC_017639	CAA	2	6	41990	41995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_017639	ATC	2	6	42000	42005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_017639	TACTTT	2	12	42015	42026	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
160	NC_017639	CATT	2	8	42030	42037	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
161	NC_017639	ATT	2	6	42042	42047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017639	CA	3	6	42050	42055	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
163	NC_017639	TA	3	6	42067	42072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_017639	AGT	2	6	42080	42085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
165	NC_017639	A	6	6	42102	42107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_017639	TG	3	6	47096	47101	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
167	NC_017639	A	6	6	47110	47115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_017639	CTG	2	6	48135	48140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_017639	ATG	2	6	48201	48206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
170	NC_017639	GA	3	6	48226	48231	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
171	NC_017639	ATA	2	6	48281	48286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_017639	GAA	2	6	48307	48312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
173	NC_017639	C	7	7	48354	48360	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
174	NC_017639	TTTG	2	8	48406	48413	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
175	NC_017639	T	6	6	48513	48518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_017639	GCT	2	6	48619	48624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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179	NC_017639	CAT	2	6	48739	48744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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181	NC_017639	TAT	2	6	48872	48877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_017639	T	6	6	48982	48987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_017639	GCG	2	6	49526	49531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
184	NC_017639	ATT	2	6	49536	49541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_017639	TCA	2	6	49645	49650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
186	NC_017639	ATG	2	6	50296	50301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
187	NC_017639	TCA	2	6	50387	50392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
188	NC_017639	GGC	2	6	50414	50419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
189	NC_017639	TTA	2	6	50545	50550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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193	NC_017639	GGC	2	6	51337	51342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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195	NC_017639	GAA	2	6	51487	51492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
196	NC_017639	AAAT	2	8	51543	51550	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_017639	ACTC	2	8	51551	51558	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
198	NC_017639	TCA	2	6	51570	51575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
199	NC_017639	T	6	6	51594	51599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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274	NC_017639	CCGCC	2	10	63891	63900	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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278	NC_017639	CCGT	2	8	65027	65034	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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280	NC_017639	GGC	2	6	65073	65078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_017639	CAA	2	6	65088	65093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_017639	CA	3	6	65095	65100	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
283	NC_017639	AGTG	2	8	65145	65152	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
284	NC_017639	ATG	2	6	65178	65183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
285	NC_017639	GGT	2	6	65221	65226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_017639	AGG	2	6	65343	65348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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290	NC_017639	CAA	2	6	65487	65492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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292	NC_017639	GGCG	2	8	65528	65535	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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341	NC_017639	CGG	2	6	75621	75626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.